O IPT mantém um data center que inclui informações de arquivo relacionadas às atividades anteriores de grupos terroristas islâmicos conhecidos. Eles também investigam suspeitos de atividades de financiamento e redes de extremistas islâmicos nos EUA e no exterior. O IPT obtém informações de várias fontes, incluindo "sites, serviços de listagem, publicações, informantes, gravações secretas, registros do governo, documentos judiciais e assim por diante". O IPT forneceu evidências úteis para agências policiais e governamentais e, ocasionalmente, fornece evidências de depoimento durante as audiências especiais do Comitê do Congresso dos EUA.
Em abril de 2006, a Emerson organizou o Projeto Investigativo sobre Terrorismo Foundation como uma organização sem fins lucrativos e atua como diretor executivo. Em janeiro de 2007, o IRS concedeu o status de isenção de impostos da organização. O status sem fins lucrativos da organização recebeu muita escrutínio dos críticos. De acordo com um artigo publicado em The Tennessean por Bob Smietana, as alegações de laços entre a instituição de caridade recém-organizada e a empresa com fins lucrativos da Emerson, SAE, foram levados à atenção do IRS. Alega-se que os dólares isentos de impostos da fundação estavam sendo canalizados para a produtora de Emerson, violando a lei. Um porta -voz da SAE Productions, da Emerson, disse que a abordagem já havia sido examinada pelos advogados do grupo e declarou legal, que foi criada dessa maneira por razões de segurança, e ele explicou ainda que Emerson não recebe lucros da SAE Productions. Nenhuma acusação formal foi feita ou ações disciplinares tomadas contra Emerson. A fundação manteve seu status sem fins lucrativos.
De acordo com um artigo no trimestre trimestral do Oriente Médio do Oriente Médio, "o IPT tem acesso a informações e inteligência às quais o governo não está privado e tem sido fundamental para desligar mais de uma dúzia de terroristas de caridade islâmicos e grupos de frente não violentos desde 2001. "
Nos ensaios de 2007 e 2008 da Holy Land Foundation - a acusação se baseou em evidências produzidas pelo IPT, um dos três grupos responsáveis por grande parte da análise de exposições e links da Holy Land Foundation (HLF) ao Hamas, a Irmandade Muçulmana (MB) e a rede MB estendida. Em 27 de maio de 2009, no Tribunal Federal de Dallas, "O juiz distrital dos EUA, Jorge A. Solis, condenou a Holy Land Foundation for Relief and Development (HLF) e cinco de seus líderes após suas condenações por um júri federal em novembro de 2008 sob acusações de Fornecer apoio material ao Hamas, uma organização terrorista estrangeira designada ". Como resultado dos vastos arquivos do IPT sobre as atividades dos grupos da frente do Hamas nos policiais dos Estados Unidos, comentaram que o IPT teve um papel instrumental na acusação e condenação da Holy Land Foundation, um julgamento que resultou em condenações abrangentes para todos os réus em 2008.
O braço de arrecadação de fundos do Projeto Investigativo sobre Terrorismo é o Projeto Investigativo sobre Fundação Terrorismo, uma organização 501 (c) (3) isenta de impostos criada em 2006 por Steven Emerson. A Fundação é operada em grande parte pela SAE Productions, uma empresa com sede em Delaware, que também foi fundada por Emerson em 1994. De acordo com um oficial da SAE Productions, o acordo evita a necessidade de o tipo de divulgação pública associada à exinição de impostos e é necessário por razões de segurança: "A própria natureza de nosso trabalho exige que protejemos a organização e sua equipe de ameaças representadas por aqueles que são o assunto ou nossa pesquisa, preservando a confidencialidade de nossos métodos".
Um artigo de Bob Smietana no Nashville Tennessean diz que o dinheiro é transferido da Fundação sem fins lucrativos para a empresa de produção com fins lucrativos, SAE. Em 2008, a organização sem fins lucrativos pagou US $ 3.390.000 à SAE Productions pelo que foi descrito como "serviços de gerenciamento", enquanto Emerson era o único oficial da SAE. O IPT publicou uma declaração em resposta observando que "em questão na história de Tennessean é a relação entre a Fundação IPT, uma instituição de caridade isenta de impostos, e a SAE Productions, uma empresa com fins lucrativos administrada pelo diretor executivo do IPT, Steven Emerson. A Fundação aceita Doações e contratos privados com a SAE para gerenciar operações ".
O IPT declarou que "não aceita financiamento de fora dos Estados Unidos ou de qualquer agência governamental ou instituições políticas ou religiosas". Em 2002 e 2003, Emerson recebeu um total de US $ 600.000 em doações da Smith Richardson Foundation, uma Fundação de Política de Políticas de Ligações Conservadoras. De acordo com o Projeto Islamofobia do Centro de Progresso Americano, entre 2009 e 2012, o IPT recebeu US $ 1.409.585 em financiamento do think tank conservador o fórum do Oriente Médio.
O think tank liberal, Center for American Progress (CAP), afirmou que o IPT era uma das dez fundações que constituíam o que chamou de "a rede de islamofobia na América". Robert Marinov e Daniel Stockemer também citaram o IPT como entre as "redes de islamofobia", redes de organizações e sua respectiva propaganda que "estão entre as" principais fontes "que geram sentimentos e retóricos anti-islâmicos". Deepa Kumar descreveu o IPT como entre as "principais fontes de racismo anti-muçulmano" promovendo a idéia "de que existe uma conspiração dos muçulmanos para assumir os Estados Unidos" e afirmou que Emerson fundou o IPT "para divulgar de maneira mais consistente as teorias da conspiração sobre o Ameaça islâmica ". Michael Loadenthal mencionou o IPT como um "exemplo óbvio" de uma organização "representa [ing] motivos políticos com velas veladas tipicamente infundidas com bolsas de estudos e relatórios extremamente seletivos", embora ele também tenha reconhecido que o IPT forneceu fácil "acesso a materiais judiciais de julgamentos de terrorismo. "
Em dezembro de 2021, foi revelado que Romin Iqbal, na época o líder do capítulo de Colombo do Conselho de Relações Americanas-Islâmicas, estava passando informações confidenciais para o IPT, incluindo gravações de voz de conversas privadas. Iqbal foi posteriormente demitido.